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HPV阳性39型是否严重要结合感染时间、TCT检查结果、阴道镜检查结果等因素进一步判断，HPV阳性39型是指感染人乳头瘤病毒的39型，根据临床经验分析不严重的居多。
1、HPV感染时间：单纯感染HPV阳性39型，且持续时间较短，TCT检查无异常，一般不严重。
2、TCT检查结果：若感染时间较长，达到一年以上，则视为高危型HPV持续感染，这种情况下比较严重，无论TCT检查结果如何，都要进行阴道镜检查，判断宫颈病变程度。
3、阴道镜结果严重程度分以下四种：（1）提示慢性炎症，证明病情较轻，可以通过自行代谢或药物治疗，如重组人干扰素α2b凝胶、更昔洛韦分散片等药物进行治疗，并定期复查。（2）低度病变（LSIL）即CIN1，严重程度中度，自行代谢的几率较低，通常需要用药治疗，如更昔洛韦分散片、等药物进行治疗，才能清除病毒。（3）高度病变(HSIL)即CIN2-CIN3，这时比较严重，已经符合手术指标，可通过leep刀、宫颈锥切、子宫全切术清除病变，并结合术后病理检查结果，进行下一步治疗。（4）宫颈癌，如果已经达到宫颈癌的程度最为严重，则需要按照宫颈癌的分期，以及个人身体情况选择治疗方法。
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