功能性胃肠病并无单一专治药，临床常根据具体症状选用马来酸曲美布汀片、匹维溴铵片、双歧杆菌三联活菌胶囊、复方消化酶胶囊、多潘立酮片等药物进行对症治疗。
1.调节动力
马来酸曲美布汀片主要用于调节胃肠道运动功能。该药具有双向调节作用，既能抑制亢进的胃肠运动，又能兴奋低下的胃肠运动，从而改善因胃肠动力紊乱引起的腹痛、腹胀及排便习惯改变。它适用于肠易激综合征等功能性胃肠病患者，帮助恢复肠道正常的节律性收缩，缓解腹部不适感，但需在医生评估后使用，不可自行随意增减剂量。
2.解痉止痛
匹维溴铵片是一种高选择性的钙离子通道拮抗剂，专门作用于胃肠道平滑肌。它能有效阻断钙离子内流，从而松弛痉挛的肠道平滑肌，显著缓解功能性胃肠病引发的剧烈腹痛和腹部绞痛。该药对于伴有肠道高敏感性的患者尤为适用，能降低内脏敏感度，减少疼痛信号的传递，改善患者的生活质量，使用时应遵循医嘱整片吞服。
3.调节菌群
双歧杆菌三联活菌胶囊含有长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌三种有益活菌。这些益生菌进入肠道后能定植并繁殖，抑制有害菌生长，重建肠道微生态平衡。对于因菌群失调导致的腹泻、便秘或交替出现的排便异常有良好疗效，同时还能辅助合成维生素，增强肠道黏膜屏障功能，减轻气体产生过多的情况，需冷藏保存以保持活性。
4.助消化酶
复方消化酶胶囊含有多种消化酶，如胃蛋白酶、胰酶、纤维素酶等，能补充人体自身分泌不足的消化酶类。它有助于分解食物中的蛋白质、脂肪和碳水化合物，促进营养物质的吸收，减轻因消化不良引起的餐后饱胀、早饱、嗳气及恶心呕吐等症状。对于功能性消化不良患者，该药能有效缓解上腹部不适，改善食欲，应在餐中或餐后立即服用。
5.促进排空
多潘立酮片是外周多巴胺受体阻滞剂，能直接作用于胃肠壁，增加食管下部括约肌张力，防止胃食管反流，同时增强胃蠕动，促进胃排空。它主要用于治疗功能性消化不良引起的上腹胀满、疼痛、恶心及呕吐等症状，能协调胃与十二指肠的运动，防止胆汁反流，但不建议长期大剂量使用，以免引起心脏方面的不良反应，须严格遵医嘱。
功能性胃肠病的调理需要综合施策，患者在遵医嘱规范用药的同时，应保持规律作息，避免熬夜和过度劳累，饮食上宜清淡易消化，少吃辛辣刺激、生冷油腻及产气较多的食物，戒烟限酒，适量摄入富含膳食纤维的蔬菜水果以维持肠道通畅。此外，心理因素对该病影响较大，建议保持心情舒畅，避免焦虑紧张情绪，可适当进行散步、瑜伽等舒缓运动，若症状持续不缓解或加重，应及时前往医院消化内科复诊，切勿盲目自行购药长期服用。
