灰指甲通常可以通过中药外洗、浸泡、涂擦以及内服等方式进行治疗，但建议在专业中医师辨证指导下进行，以提高疗效并减少副作用。
中药治疗灰指甲主要依据中医理论，认为其多由湿热蕴结、虫毒侵染或血虚风燥所致，治疗上常采用内外合治的方法。外治法方面，常用具有杀虫止痒、祛湿解毒功效的中药煎水浸泡或涂擦患甲，例如使用土荆皮、苦参、黄柏、蛇床子、地肤子等药材，将其煎煮后取药液，待温度适宜时浸泡病甲，每次持续20到30分钟，每日进行一到两次。浸泡后可用小刀或指甲锉轻轻刮除病甲表面的污物和增厚部分，有助于药物渗透。此外，也有将中药研成细粉，用醋或凡士林调成糊状外敷的用法。内治法方面，中医会根据患者的具体证型开具汤剂，如针对湿热证型，可能会使用清热利湿的方药；针对血虚风燥证型，则可能选用养血润燥的方药。需要强调的是，中药治疗灰指甲的周期通常较长，因为指甲生长缓慢，一般需要坚持用药三到六个月甚至更久，直到健康的新甲完全长出。治疗期间，患者应注意保持手足的清洁干燥，避免与他人共用拖鞋、毛巾、指甲剪等个人物品，以防交叉感染。同时，穿着透气性好的鞋袜，并定期更换、清洗和晾晒，有助于抑制真菌滋生。由于灰指甲可能合并手足癣，若身体其他部位也有真菌感染，应一并治疗，否则容易相互传染导致复发。如果外用药效果不佳或病情严重，医生也可能会建议结合西医的抗真菌药物进行综合治疗，但所有用药方案均需在专业指导下进行，不可自行盲目用药。
在日常生活中，患者可以适当摄入富含蛋白质和维生素的食物，如鸡蛋、牛奶、瘦肉以及新鲜蔬菜水果，这些营养素有助于指甲的健康生长。同时，避免长期将手足浸泡在潮湿环境中，工作或家务时如需接触水或化学洗涤剂，建议佩戴手套。定期修剪指甲，但不要剪得过短或损伤甲周皮肤。保持积极心态和规律作息，增强自身免疫力，对疾病的康复也有积极作用。如果治疗过程中出现局部红肿、疼痛或过敏反应，应及时停药并咨询医生。
