聚甲酚磺醛凝胶的禁忌主要包括妊娠期、伤口面积过大、对组分过敏等情形。使用前需严格遵医嘱，避免接触眼部及开放伤口。
聚甲酚磺醛凝胶可能对胎儿发育造成不良影响，妊娠期女性禁止使用该药物。药物成分可能通过胎盘屏障，导致胎儿畸形或流产风险升高。孕妇若需治疗宫颈病变应选择其他替代方案。
该药物具有强腐蚀性，直接接触面积过大的开放伤口会导致组织灼伤。临床上仅适用于小范围浅表性创面，使用时应避开黏膜破损区域。重度皮肤溃烂患者需采用生物敷料等无刺激性疗法。
对聚甲酚磺醛或辅料成分过敏者可能出现皮肤红肿、瘙痒等不良反应。首次使用前建议在小臂内侧进行皮肤测试，观察24小时无异常反应方可继续用药。过敏反应严重时可引发过敏性休克。
药物意外接触眼睛会腐蚀角膜，造成永久性视力损伤。操作时应佩戴护目镜，若不慎入眼需立即用大量生理盐水冲洗15分钟以上，并及时就诊眼科。眼部手术前后2周内禁止使用该凝胶。
哺乳期妇女使用可能导致乳汁含药，应暂停哺乳。儿童生殖道黏膜娇嫩，12岁以下禁用。肝肾功能不全者代谢能力下降，须在医生监护下调整用量，避免药物蓄积中毒。
使用聚甲酚磺醛凝胶期间应保持治疗部位清洁干燥，避免同用其他外用制剂。用药后出现持续灼痛、渗出液增多等异常需立即停用并就医。日常需穿透气棉质内衣，减少局部摩擦，禁止盆浴及性生活至创面完全愈合。存储时置于25℃以下阴凉处，确保儿童无法接触。
