云南白药主要用于治疗跌打损伤、软组织挫伤、瘀血肿痛等外伤性病症以及痈肿疮毒等感染性疾病。药物使用需要在医生指导下进行，避免自行用药造成症状加重或延误治疗时机。
云南白药可通过外用方式治疗因外力作用导致的皮下毛细血管破裂疼痛症状。药物中的草乌甲素等成分有助于改善局部血液循环，该药可直接喷洒于患处或使用纱布绷带固定敷料。典型适应证包括运动性关节扭伤、肌肉拉伤等情况，但皮肤存在开放性伤口时应禁用，孕妇禁止大面积长期使用。临床常见配合使用的药物包括云南白药气雾剂、云南白药酊剂、云南白药膏等不同剂型。
对各类闭合性损伤引起的局部肿胀疼痛具有缓解效果，其含有的三七皂苷等成分可抑制血小板聚集。适用于术后血肿、碰撞伤等情况，用药期间应观察是否出现皮肤过敏反应。若肿胀持续加重或伴随肢体活动障碍，需警惕骨关节损伤可能，应及时就医进行影像学检查。复方制剂如云南白药胶囊可与外用药联合使用，但须注意与其他抗凝药物的相互作用。
针对皮肤未破损的肌肉韧带损伤有明确疗效，通过抑制局部炎症介质释放减轻红肿热痛症状。常见于搬运重物导致的腰肌劳损、意外撞击引起的皮下出血等情况。初次使用前建议在手腕内侧进行过敏测试，使用后避免立即热敷以免加重毛细血管渗出。可与物理疗法联合应用，但对肌腱断裂等严重损伤仍需手术修复。
对早期皮肤感染形成的疖肿有消肿散结作用，其药物组成中的重楼等成分具有抗菌效果。适用于毛囊炎初期、小面积蜂窝织炎等情况，但形成明显脓腔或伴随发热等全身症状时须及时进行抗生素治疗。外用时避开眼口鼻等黏膜部位，儿童使用需在成人监护下进行。不建议与碘酊等消毒剂同时使用以免影响药效。
云南白药粉剂对轻型牙周炎导致的牙龈渗血有止血作用，使用时取少量药粉按压于出血部位。因含有冰片等成分，能暂时性缓解牙周组织充血症状，但需配合口腔专科治疗消除菌斑结石等根本病因。长期反复出血可能提示血液系统疾病，应及时进行血常规检查。孕妇及哺乳期妇女使用前应咨询医师。
使用云南白药期间应注意保持创面清洁干燥，避免接触刺激性化学物质。外伤患者应适当限制患肢活动，观察肿胀消退情况。口腔用药后30分钟内避免进食饮水，皮肤用药部位出现瘙痒灼热感应立即停用。药物应存放在阴凉避光处，开封后超过六个月不宜继续使用。若症状未见缓解或持续加重，应及时至外科、口腔科等相关科室就诊完善检查。
