附子理中丸主要用于治疗脾胃虚寒引起的脘腹冷痛、呕吐泄泻、手足不温等症状，可遵医嘱用于慢性胃肠炎、胃溃疡、功能性消化不良等疾病。
慢性胃肠炎患者因脾胃阳虚导致腹部隐痛、腹泻反复发作时，附子理中丸可通过温中散寒改善症状。其成分附子、干姜能促进胃肠血液循环，党参、白术可调节消化功能。需注意与肠道感染性腹泻鉴别，合并细菌感染时需联合抗生素治疗。
对于寒凝气滞型胃溃疡出现的胃脘冷痛、喜温喜按等症状，该药能抑制胃酸分泌并增强胃黏膜屏障。但出现呕血、黑便等出血表现时禁用，需及时进行胃镜检查明确病情。
脾胃虚寒型功能性消化不良表现为餐后腹胀、食欲减退时，附子理中丸可促进胃排空。其生姜成分能刺激消化液分泌，改善胃动力不足。建议配合少食多餐、避免生冷饮食。
腹泻型肠易激综合征伴腹部畏寒、排便后腹痛缓解者，该药可通过调节肠道平滑肌收缩缓解症状。但需排除炎症性肠病等器质性疾病，治疗期间需保持情绪稳定。
腹部手术后出现胃肠蠕动减弱、腹胀便秘时，在排除机械性梗阻后，小剂量使用可促进肠鸣音恢复。需在医生监测下使用，避免与麻醉镇痛药物相互作用。
服用期间忌食生冷油腻，注意腹部保暖。出现口干舌燥、心悸等热性反应时应停药。慢性病患者需定期复查肝肾功能，孕妇及阴虚火旺者禁用。建议配合艾灸中脘、足三里等穴位增强疗效，症状持续不缓解需完善胃肠镜检查。
