胡芦巴的禁忌主要包括孕妇禁用、过敏体质者慎用、胃肠疾病患者慎用、低血糖患者需警惕以及避免与特定药物同服。
胡芦巴含有植物雌激素成分，可能刺激子宫收缩，增加流产或早产风险。孕妇食用后可能出现腹痛、阴道出血等先兆流产症状。妊娠期女性应完全避免摄入胡芦巴籽、提取物及相关制品，包括茶饮和膳食补充剂。若误食出现不适，需立即停用并就医监测胎儿状况。
胡芦巴可能引发荨麻疹、呼吸困难等过敏反应，尤其对豆科植物过敏者风险更高。初次使用者建议先进行皮肤测试，将少量胡芦巴粉末涂抹于前臂，观察24小时无红肿瘙痒再使用。过敏体质者服用期间如出现舌头发麻、皮疹等症状，应立即停药并服用氯雷他定片等抗组胺药物缓解。
胡芦巴中的黏性纤维可能加重胃肠负担，胃炎、肠易激综合征患者食用易诱发腹胀、腹泻。胃溃疡患者服用可能刺激胃酸分泌，加剧烧心症状。建议此类人群避免空腹食用，单日摄入量不超过3克，可与小米粥等易消化食物同服减轻刺激。
胡芦巴具有降血糖作用，糖尿病患者联合降糖药使用可能导致血糖过低，出现冷汗、头晕等低血糖反应。使用胰岛素或格列本脲片等药物的患者，需在医生指导下调整剂量并密切监测血糖。普通人群长期大量服用也可能引发反应性低血糖。
胡芦巴可能增强抗凝血药物华法林的效果，增加出血风险；与甲状腺激素类药物左甲状腺素钠片同服可能影响药效。服用上述药物期间应间隔2小时以上使用胡芦巴，或咨询医生后停用。其他需注意的药物还包括免疫抑制剂和部分抗抑郁药。
使用胡芦巴前建议咨询中医师或营养师，根据体质调整用法用量。正常人群每日摄入量建议控制在5克以内，连续服用不超过3个月。出现恶心、头痛等不适时应立即停用，饮用大量温水促进排泄。储存时需密封防潮，避免有效成分挥发。特殊人群如哺乳期女性、儿童使用前必须获得专业指导。
