牙周炎没有绝对“最好”的单一药物，治疗需结合局部清洁与全身用药，常用有效药物包括甲硝唑片、阿莫西林胶囊、盐酸米诺环素软膏、复方氯己定含漱液、碘甘油等。
1.甲硝唑片
甲硝唑片是治疗厌氧菌感染引起的牙周炎的经典口服药物。牙周炎往往伴随牙龈卟啉单胞菌等厌氧菌的大量繁殖，导致牙龈红肿、出血及牙周袋形成。该药能有效抑制厌氧菌生长，减轻炎症反应。使用时需严格遵医嘱，通常与其他抗生素联合应用以增强疗效，孕妇及哺乳期妇女慎用，服药期间禁止饮酒，以免引发双硫仑样反应。
2.阿莫西林胶囊
阿莫西林胶囊属于青霉素类广谱抗生素，常与甲硝唑配合使用治疗中重度牙周炎。它能破坏细菌细胞壁合成，对多种革兰氏阳性菌和部分革兰氏阴性菌具有杀灭作用，有助于控制牙周组织的急性感染，缓解牙齿松动和疼痛症状。对青霉素过敏者禁用，使用前必须进行皮试，且必须在医生指导下确定疗程，不可自行随意增减剂量或停药。
3.盐酸米诺环素软膏
盐酸米诺环素软膏是一种局部缓释抗菌制剂，专门用于牙周袋内的给药。对于深牙周袋患者，口服药物难以在局部达到高浓度，将此软膏注入牙周袋后，可缓慢释放药物成分，长时间维持有效杀菌浓度，直接作用于病灶深处，促进牙周组织再生。该方法由专业医生操作，能显著减少全身用药的副作用，提高局部治疗效果。
4.复方氯己定含漱液
复方氯己定含漱液是临床常用的辅助治疗药物，主要用于口腔日常护理和术前术后消炎。它具有广谱抑菌作用，能有效减少口腔内菌斑堆积，抑制牙结石形成，从而减轻牙龈充血和水肿。适用于牙周炎的日常维护期或急性发作期的辅助冲洗，但长期使用可能导致牙齿着色或味觉改变，建议间断使用或遵医嘱调整使用频率。
5.碘甘油
碘甘油是一种传统的局部外用消毒剂，常用于牙龈沟或牙周袋的涂抹治疗。其释放的游离碘具有强大的杀菌和收敛作用，能迅速改善牙龈糜烂、渗出等症状，促进黏膜愈合。医生通常会先用器械清除牙石和菌斑，再将碘甘油涂布于患处，特别适合伴有牙龈脓肿或溃疡的牙周炎患者，使用时需注意避免误吞，对碘过敏者禁用。
药物治疗仅是牙周炎综合治疗的一部分，无法替代机械性的洁治和刮治。患者应养成早晚刷牙、饭后漱口的习惯，掌握正确的巴氏刷牙法，并定期使用牙线清洁牙缝。饮食上应减少糖分摄入，多吃富含维生素C的蔬菜水果以增强牙龈抵抗力，避免过硬过烫食物刺激患处。务必定期前往正规医疗机构进行牙周检查和专业洁牙，一旦发现牙龈出血或口臭加重，应及时就医，切勿单纯依赖药物而延误病情，导致牙齿松动脱落。
