药艾条的使用方法主要有悬灸法、回旋灸法、雀啄灸法、温和灸法、隔物灸法五种。
将点燃的药艾条悬于施灸部位上方约3厘米处，保持固定高度进行熏烤。适用于需要持续温热的穴位，如足三里、关元等。施灸时以局部皮肤出现红晕为度，注意避免灼伤。悬灸法对寒性腹痛、关节冷痛有缓解作用，建议每次施灸15分钟左右。
手持点燃的药艾条在施灸部位上方3-5厘米处做环形回旋运动，范围约5厘米直径。适用于面积较大的肌肉酸痛区域，如腰背部。通过均匀加热可促进局部血液循环，改善气滞血瘀症状。操作时需保持动作连贯，每个部位回旋3-5圈后移动位置。
将药艾条点燃端对准穴位像雀鸟啄食般一起一落施灸，距离皮肤2-3厘米。适用于需要较强刺激的穴位如合谷、内关等。此法通过间断性热刺激能激发经络感应，对头痛、牙痛等急症效果明显。每次每穴啄灸7-10次，注意控制下落速度防止烫伤。
将药艾条倾斜45度角靠近施灸部位，保持1-2厘米距离缓慢平移。适用于老人、儿童等耐热力较差人群，或面部等皮肤较薄区域。温和灸法产生的辐射热可渗透至皮下组织，对慢性虚寒病症有调理作用。施灸时以患者感觉温热舒适为宜。
在皮肤与药艾条之间放置姜片、蒜片或盐等介质进行隔物施灸。适用于需要加强药效渗透或保护敏感皮肤的情况。隔姜灸多用于寒湿痹症，隔蒜灸常用于痈肿初起。介质厚度以2-3毫米为宜，灸至介质表面干燥微黄即需更换。
使用药艾条时需选择通风环境，施灸后注意保暖避免受风。艾灸前后1小时内不宜进食生冷食物，施灸部位出现水泡应暂停使用。孕妇腹部腰骶部、高热患者、皮肤溃疡处禁用。建议在专业医师指导下根据体质症状选择合适灸法，每周施灸2-3次为宜，长期坚持可调节气血运行。施灸后适量饮用温水有助于代谢艾烟产物。
