秘诀清凉散具有清热解毒、活血化瘀、消肿止痛等作用，主要用于治疗热毒壅盛引起的咽喉肿痛、疮疡肿痛、跌打损伤等症状。
秘诀清凉散中的牛黄、麝香等成分具有显著的抗菌抗炎作用，可抑制金黄色葡萄球菌、链球菌等常见致病菌。对于热毒壅盛导致的口腔溃疡、急性扁桃体炎等上呼吸道感染症状，能够快速缓解局部红肿热痛。该药还可用于皮肤疖肿初起未溃时，能减少化脓感染风险。
配方中的三七、血竭等药材可改善微循环，促进组织修复。对于跌打损伤造成的软组织淤血肿胀，能加速瘀血吸收。临床观察显示，该药对闭合性骨折早期肿胀的消退效果明显，通常配合夹板固定使用。使用期间可能出现局部皮肤轻微发热感，属于药物起效的正常现象。
秘诀清凉散的冰片、薄荷脑成分具有局部麻醉和清凉效果，可快速缓解蚊虫叮咬、轻度烫伤等引起的皮肤瘙痒疼痛。对于牙龈炎导致的牙龈肿胀，用棉签蘸取少量药物外敷能减轻不适。孕妇及过敏体质者需谨慎使用，出现皮疹等过敏反应应立即停用。
研究发现该药所含人工牛黄可通过调节巨噬细胞活性增强机体免疫力。在流感季节，早期用于风热感冒症状如头痛发热时，可缩短病程。但不宜长期连续使用，通常建议疗程不超过7天。儿童使用时需遵医嘱减量，避免影响胃肠功能。
对于外感风热引起的低中度发热，该药通过发汗解表作用帮助降温。使用时可将药物溶于温水服用，配合物理降温效果更佳。但体温超过38.5℃或持续发热时应及时就医，避免单纯依赖中药延误病情。服药期间应多饮水，保持清淡饮食。
使用秘诀清凉散期间应注意保持患处清洁干燥，避免辛辣刺激性食物。外用药时需先清洁创面，內服时应严格按说明书或医嘱控制用量。如症状持续3天无改善，或出现腹泻、心悸等不良反应，应及时停药就医。孕妇、哺乳期妇女及肝肾功能不全者应在医师指导下使用，不可与其他清热解毒类药物同时服用。
