目前没有特效药物能直接清除HPV病毒，但可通过干扰素栓、保妇康栓、抗HPV生物蛋白敷料等药物辅助治疗，同时需结合物理治疗或手术切除病变组织。HPV感染的治疗主要针对病毒引起的病变和症状，而非病毒本身。
1、干扰素栓
重组人干扰素α2b栓可用于宫颈HPV感染伴糜烂的治疗。该药物通过调节局部免疫功能抑制病毒复制，常见剂型为栓剂，需阴道给药。使用期间可能出现轻微灼热感，孕妇禁用。需配合定期宫颈癌筛查。
2、保妇康栓
保妇康栓为中成药，含莪术油等成分，适用于HPV感染引起的宫颈炎性病变。具有行气破瘀、生肌止痛功效，剂型为栓剂。用药期间禁止性生活，月经期停用。可能出现阴道分泌物增多等反应。
3、抗HPV生物蛋白敷料
抗HPV生物蛋白敷料通过阻断病毒与宿主细胞结合发挥作用，适用于宫颈高危型HPV感染。需由医生进行阴道穹窿敷贴，治疗期间需避免剧烈运动。可能出现短暂阴道充血现象。
4、咪喹莫特乳膏
咪喹莫特乳膏为免疫调节剂，可用于HPV引起的生殖器疣体治疗。通过刺激局部细胞因子产生清除疣体，剂型为5%浓度乳膏。使用时可能出现皮肤红肿、溃疡等反应，需间隔用药。
5、鬼臼毒素酊
鬼臼毒素酊适用于肛周、外生殖器尖锐湿疣的化学腐蚀治疗。该药物通过抑制疣体细胞分裂起作用，剂型为酊剂。需由医生精准点涂疣体，正常皮肤接触可能导致溃烂，孕妇绝对禁用。
HPV感染的治疗需根据病毒分型、病变程度制定个性化方案。高危型持续感染需每6个月进行TCT和HPV联合筛查，低危型以去除疣体为主。日常应避免多个性伴侣、吸烟等危险因素，接种HPV疫苗可预防相关型别感染。所有药物治疗均需在医生指导下进行，不可自行用药。
