避孕药和人工流产相比，通常规范使用避孕药的危害更小，而人工流产尤其是重复流产的危害更大。但在特定情况下如未正确使用避孕药导致意外怀孕，或出现严重药物不良反应时，两种方式的危害程度会发生变化。
规范使用的避孕药属于可逆的生育调控手段，其优点在于方便、有效率高、不影响未来生育能力，并且部分复方口服避孕药还能调节月经周期、减少痤疮和降低卵巢癌风险。人工流产作为终止妊娠的补救措施，其优点在于能迅速解决意外妊娠问题，但在医疗条件完善的情况下仍存在一定风险。从危害角度看，避孕药的缺点主要包括类早孕反应如恶心、头晕，少数人可能出现不规则阴道出血、体重增加、情绪波动，长期使用者有极低概率发生静脉血栓。而人工流产的危害远高于避孕药，手术操作可能直接损伤子宫内膜导致宫腔粘连、继发感染引发盆腔炎、术中或术后大出血、子宫穿孔，远期可能造成月经失调、习惯性流产甚至继发不孕。药物流产虽可避免手术创伤，但存在流产不全需二次清宫、出血时间长、过敏反应等风险。重复人工流产对生殖系统的累积损伤尤为显著，可能永久影响生育能力。
建议女性优先选择可靠的避孕措施如复方短效口服避孕药、宫内节育器或避孕套，避免将人工流产作为常规避孕手段。若发生无保护性行为，应在医生指导下及时服用紧急避孕药。一旦确诊意外妊娠并决定终止，需尽早到正规医疗机构评估选择适宜方式，术后注意休息、加强营养、一个月内禁止性生活，并落实长效避孕方案以保护生殖健康。
