复方鱼腥草合剂主要用于治疗由风热犯肺引起的急性咽炎、急性扁桃体炎等上呼吸道感染疾病。
一、急性咽炎
复方鱼腥草合剂对风热犯肺型急性咽炎有明确疗效，可缓解咽干咽痛、吞咽困难等症状。其含鱼腥草、黄芩等成分能抑制金黄色葡萄球菌等常见病原体，减轻咽部黏膜充血水肿。需注意避免与寒凉性中药同服，脾胃虚寒者慎用。
二、急性扁桃体炎
针对急性扁桃体炎引发的发热、扁桃体肿大，该药通过抗炎解毒作用改善局部淋巴细胞浸润。联合用药时可配蓝芩口服液增强疗效，但化脓性扁桃体炎需加用抗生素治疗。用药期间应保持口腔清洁，忌食辛辣刺激食物。
三、上呼吸道感染
对于病毒性上呼吸道感染早期出现的鼻塞流涕、咽喉肿痛，复方鱼腥草合剂能阻断病毒复制进程。所含连翘苷等成分可调节机体免疫功能，缩短病程。若出现持续高热需警惕合并细菌感染，应及时就医检查血常规。
四、痰热咳嗽
风热袭肺所致的咳嗽痰黄、咯痰不爽症状，药物中鱼腥草素可稀释痰液，黄芩苷能舒张支气管平滑肌。与肺力咳合剂联用效果更佳，但慢性支气管炎急性发作需配合雾化治疗。用药期间应多饮温水促进代谢。
五、热毒疮疡
对皮肤疖肿等热毒性皮损，该药可通过内服发挥清热解毒功效。其中野菊花成分能抑制局部炎症因子释放，减轻红肿热痛。重度感染需外敷莫匹罗星软膏联合治疗，糖尿病患者需警惕伤口继发感染。
使用复方鱼腥草合剂期间应戒烟酒及辛辣食物，注意观察是否出现皮疹等过敏反应。咽炎患者可配合淡盐水漱口，扁桃体炎患者建议流质饮食。若用药3天症状无改善或出现体温超过38.5℃、呼吸急促等情况，应立即停用并就诊。储存时需密封避光，开盖后建议15天内用完以保证药效。
