健脾五味丸的主要禁忌包括孕妇、哺乳期妇女及对药物成分过敏者禁用，用药期间忌食生冷油腻食物。该药含有毒性药材，须严格遵医嘱控制剂量，不可长期过量服用。心脑血管疾病患者、肝功能异常者及儿童需在医生指导下谨慎使用。
健脾五味丸含有红花等活血化瘀成分，可能刺激子宫收缩导致流产风险。哺乳期服药可能通过乳汁影响婴幼儿发育，哺乳妇女应选择替代治疗方案。用药前需确认未怀孕，服药期间发现妊娠需立即停药就医。
药物含诃子、土木香等多味药材，易引发皮肤瘙痒、红疹等过敏反应。既往有中药过敏史者用药前需进行皮试，出现唇部麻木或呼吸困难等严重过敏症状时，应采取抗过敏治疗并永久停用该药。
冠心病患者服用可能加重心悸症状，肝功能不全者会延缓药物代谢引发中毒。此类患者需调整剂量或改用其他健脾药物，用药期间需定期监测心电图和肝肾功能指标。
服药期间食用绿豆、萝卜等解药性食物会降低疗效，辛辣刺激食物可能加重胃肠不适。建议用药前后2小时避免饮茶或咖啡，饮食以清淡易消化为主，可配合小米粥等养胃食物。
与洋地黄类强心药同用易引发心律失常，与抗凝药物合用可能增加出血风险。需告知医生正在使用的全部药物，中药联合使用需间隔2小时以上。
服用健脾五味丸期间应保持规律作息，避免过度劳累和情绪波动。建议每日进行30分钟温和运动如八段锦增强药效，饮食可适量添加山药、薏苡仁等健脾食材。出现恶心呕吐或持续性腹泻需立即停药，携带药品包装至医院就诊。储存时需密封避光，置于儿童无法接触的干燥处。
