性发育迟缓可能对生理和心理产生多方面影响。生理上主要表现为第二性征延迟出现、骨骼生长滞后；心理上易引发自卑、社交障碍等问题。
生理影响主要包括身高发育迟滞和性腺功能低下。骨骼闭合延迟可能导致成年身高低于遗传潜力，男性睾丸体积小于4毫升或女性16岁后仍无月经初潮属于典型表现。部分患者可能出现骨质疏松、代谢综合征等远期并发症。
心理社会适应障碍是常见问题。青春期同龄人身体变化明显时，患者容易产生焦虑和抑郁情绪，校园环境中可能遭遇同伴排斥。约40%的患者存在学习注意力不集中，部分会出现拒绝上学等行为问题。
内分泌系统异常需要重点关注。下丘脑-垂体-性腺轴功能紊乱可能导致促性腺激素释放激素分泌不足，甲状腺功能减退约占病例的15%。肾上腺皮质功能早现等特殊情况可能伴随阴毛早现但性器官不发育的矛盾现象。
生育功能受损是远期风险。男性精子生成障碍、女性卵巢储备不足都可能发生。及时干预的情况下，80%特发性体质性发育迟缓患者最终能获得正常生育能力，但治疗窗口期多集中在骨龄12-14岁阶段。
建议发现发育指标落后于同性别同龄人2个标准差以上时，尽早就诊儿童内分泌科。骨龄片、性激素激发试验、垂体MRI等检查能帮助明确病因，对中枢性发育迟缓患者，脉冲式促性腺激素释放激素治疗可获得较好效果。
