苍耳的干燥成熟带总苞果实可入药，主要适用于风寒头痛、鼻渊流涕、风疹瘙痒、风湿痹痛等疾病。需严格遵医嘱使用，避免自行服用。
1. 风寒头痛
苍耳辛温发散，能祛风散寒，适用于外感风寒引起的头痛、恶寒症状。其有效成分苍耳苷可通过抑制前列腺素合成缓解疼痛。临床常与防风、白芷配伍使用，但需注意阴虚血亏者慎用。
2. 鼻渊流涕
对慢性鼻炎、过敏性鼻炎导致的鼻塞流涕，苍耳能通鼻窍、止涕。所含挥发油可收缩鼻黏膜血管，改善通气功能。多与辛夷、薄荷同用，但不可长期连续使用超过7天。
3. 风疹瘙痒
苍耳煎汤外洗可缓解湿疹、荨麻疹等皮肤瘙痒。其抗组胺成分能抑制肥大细胞脱颗粒，减轻变态反应。皮肤溃烂处禁用，过敏体质者需先做皮试。
4. 风湿痹痛
对于风湿性关节炎引起的关节肿痛，苍耳可祛风除湿、通络止痛。常配伍羌活、独活增强疗效，但孕妇及消化性溃疡患者禁用。
5. 疮疡肿毒
鲜品捣敷可用于疔疮初起未溃时，其抗菌成分对金黄色葡萄球菌有抑制作用。已化脓者不宜使用，外用出现皮肤过敏应立即停用。
使用苍耳期间应忌食辛辣刺激食物，避免加重热性症状。风湿患者可配合低嘌呤饮食，鼻部疾病患者建议保持环境湿度。本品有毒成分易蓄积，必须严格把控剂量与疗程，出现恶心呕吐等中毒症状需立即就医。过敏体质者、孕妇及肝肾功能不全者禁用，用药期间禁止驾驶或操作机械。
