卵巢囊肿选择手术还是药物治疗需根据囊肿性质、大小及症状决定，多数生理性囊肿可药物观察，病理性或较大囊肿需手术干预。
药物治疗适用于体积较小且无恶性倾向的生理性囊肿，常用短效避孕药如炔雌醇环丙孕酮片调节激素水平，或桂枝茯苓胶囊等中成药促进吸收。这类囊肿通常伴随轻微腹胀或月经紊乱，超声显示囊壁薄且无血流信号。患者需每3-6个月复查超声监测变化，期间若出现剧烈腹痛需警惕蒂扭转可能。药物治疗期间可配合低脂高纤维饮食，避免豆制品等植物雌激素过量摄入。
手术干预适用于直径超过5厘米的持续存在囊肿、实性成分占比高或肿瘤标志物异常者。腹腔镜囊肿剥除术能保留卵巢功能，适用于年轻患者；绝经后女性若合并CA125升高可能需患侧附件切除术。术后病理确诊为子宫内膜异位囊肿者需长期管理，如注射醋酸亮丙瑞林抑制复发。急诊手术指征包括囊肿破裂导致急性腹膜炎或蒂扭转引起缺血性疼痛，此时需开放手术评估卵巢存活情况。
无论选择何种方式，均需定期妇科检查联合肿瘤标志物监测。术后患者应避免三个月内剧烈运动，药物保守治疗期间记录月经周期变化。突发下腹坠痛、发热或异常阴道流血时需及时就医，病理确诊的巧克力囊肿患者建议每半年复查阴道超声评估复发情况。
