吃紧急避孕药一般会使月经出现暂时性的不正常，例如月经提前、推迟或经量改变，但少数女性可能没有明显影响。紧急避孕药主要成分为左炔诺孕酮或醋酸乌利司他，通过高剂量激素干扰排卵和子宫内膜，从而影响月经周期。
服药后多数女性的月经周期会被打乱，常见表现为月经提前几天到来，或者推迟数天甚至一周以上。这是因为高剂量激素导致体内孕激素水平骤升，子宫内膜稳定性下降，出现撤退性出血，部分女性会误以为是月经，实际是药物引起的出血。经量也可能发生变化，有些人经量增多，有些人减少。这种影响通常是暂时的，在1到2个周期内会逐渐恢复正常。服药时间越接近排卵期，对月经的干扰可能越明显。如果服药后月经推迟超过7天，需要考虑怀孕可能，建议进行早孕检测。
少数女性由于自身月经周期非常规律，或服药时间处于月经周期的安全期（如月经刚结束），激素干扰较小，可能不会出现明显的月经异常。另外，如果女性平时月经周期本身就不规律，服用紧急避孕药后可能反而“调整”了一次周期，但这并不代表药物对月经无害。极少数情况下，药物可能引发点滴出血或闭经，但概率较低。需要注意的是，频繁服用紧急避孕药（一个月内多次使用）会显著增加月经紊乱的风险，甚至导致排卵障碍。
紧急避孕药仅用于无保护性生活后的紧急补救，不建议作为常规避孕手段。如果服药后月经异常持续超过两个周期，或者出现剧烈腹痛、大量出血等症状，应及时到妇科就诊，排除其他疾病如宫外孕的可能。平时可记录月经周期，保持规律作息，减少精神压力，有助于月经恢复稳定。饮食上适当补充铁质，避免生冷刺激食物，对维持内分泌平衡有益。
