避孕药对胎儿的影响取决于用药时间和药物类型，紧急避孕药通常对胎儿产生不良影响的概率较低，而长期服用短效避孕药后怀孕可能增加胎儿发育异常的风险。
紧急避孕药的主要成分是左炔诺孕酮，通过抑制排卵或干扰受精卵着床发挥作用。这类药物在无保护性行为后72小时内服用有效，若服药后仍怀孕，现有研究未发现明显致畸证据。药物代谢周期较短，通常不会在体内长期蓄积，对已着床的胚胎影响有限。短效避孕药含有雌激素和孕激素，需每日规律服用。停药后短期内怀孕可能因激素水平波动影响子宫内膜环境，增加早期流产风险。长期用药后妊娠可能干扰胎儿生殖系统发育，尤其是女胎男性化等异常现象。
部分复合避孕药中的高效孕激素可能干扰胚胎器官形成期发育，孕4-10周持续接触激素环境可能增加心血管畸形概率。使用雄激素活性较高的避孕药时，需警惕胎儿泌尿生殖系统发育异常。有复方炔诺酮用药史者妊娠后，胎儿出现神经管缺陷的概率略有上升。存在糖尿病或高血压的孕妇，避孕药残留效应可能加重妊娠期并发症。
建议使用避孕药后发现妊娠者及时进行超声检查和血清学筛查，孕中期需加强胎儿大排畸超声监测。妊娠期间避免接触其他致畸因素，严格遵医嘱补充叶酸等营养素。有长期避孕药使用史者建议间隔3个月经周期再备孕，用药期间意外怀孕应详细记录药物成分并告知产科医生。
