治疗胃肠炎没有绝对最好的药，需根据病因选择，常用药物有蒙脱石散、口服补液盐散、双歧杆菌三联活菌胶囊、盐酸小檗碱片、阿莫西林胶囊。
1、止泻护膜
蒙脱石散是治疗胃肠炎引起的腹泻症状的常用药物，该药能够覆盖消化道黏膜，增强黏膜屏障功能，同时吸附并固定病原体及其产生的毒素，随肠道蠕动排出体外。它适用于成人及儿童急慢性腹泻，对于病毒性或细菌性胃肠炎导致的排便次数增多、粪便稀薄等情况均有缓解作用，使用时需注意与其他药物间隔服用，以免影响其他药物吸收。
2、补水纠酸
口服补液盐散主要用于预防和治疗胃肠炎引发的轻中度脱水，通过补充丢失的水分和电解质，维持体内酸碱平衡。胃肠炎患者因呕吐或腹泻容易流失大量钠、钾等离子，导致身体乏力、口渴甚至休克，此药能有效纠正水电解质紊乱，适合在患病初期或症状较轻时自行冲服，若出现重度脱水则需立即就医进行静脉输液治疗。
3、调节菌群
双歧杆菌三联活菌胶囊含有长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，能补充肠道正常生理细菌，抑制致病菌生长，恢复肠道微生态平衡。胃肠炎发作时常伴随肠道菌群失调，表现为腹胀、消化不良或腹泻迁延不愈，服用此类益生菌制剂有助于缩短病程，改善胃肠道功能，尤其适用于抗生素相关性腹泻或慢性胃肠炎患者的辅助调理。
4、清热燥湿
盐酸小檗碱片对多种革兰氏阳性菌和阴性菌具有抑制作用，常用于治疗敏感菌引起的肠道感染。当胃肠炎由细菌感染引起，出现腹痛、里急后重或黏液脓血便时，该药可发挥抗菌消炎功效，减轻肠道炎症反应。由于其安全性较高，副作用相对较少，常作为非处方药用于轻度细菌性肠炎的治疗，但溶血性贫血患者及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏者禁用。
5、抗菌消炎
阿莫西林胶囊属于青霉素类抗生素，针对幽门螺杆菌或其他敏感细菌感染的胃肠炎有确切疗效。若确诊为细菌性胃肠炎且症状较重，如高热、剧烈腹痛或血常规显示白细胞升高，医生可能会开具此药进行系统性抗感染治疗。使用前必须进行皮试以防过敏反应，且须严格遵医嘱完成疗程，避免随意停药导致细菌耐药或病情反复。
胃肠炎患者在用药期间应保持清淡饮食，避免食用辛辣、油腻及生冷食物，以免加重胃肠负担。建议适量饮用温开水或米汤，注意休息，腹部保暖，避免受凉。若服药后症状未缓解或出现高热、意识模糊、尿量减少等严重情况，应及时前往医院就诊，切勿自行增加药量或混用多种药物，以免延误病情或引发不良反应。
