吴茱萸具有散寒止痛、降逆止呕、助阳止泻等功效，主要用于寒凝疼痛、呕吐吞酸、五更泄泻等症。
1、散寒止痛
吴茱萸性热味辛，能温通经脉、驱散寒邪，对寒凝肝脉引起的疝气疼痛、经行腹痛有缓解作用。其有效成分吴茱萸碱可抑制前列腺素合成，减轻炎症反应导致的疼痛。寒性头痛患者可用吴茱萸配伍川芎、白芷煎服，但阴虚火旺者禁用。
2、降逆止呕
该药能疏肝和胃、抑制胃气上逆，适用于肝胃不和导致的呕吐吞酸。现代研究显示其挥发油可调节胃肠平滑肌收缩，改善功能性消化不良。常与生姜、半夏同用治疗妊娠恶阻，但需注意妊娠期用药安全性。
3、助阳止泻
吴茱萸能温补脾肾阳气，配伍补骨脂、肉豆蔻可治疗五更泄泻。其甲醇提取物能抑制肠道蠕动亢进，减少腹泻次数。脾肾阳虚型慢性肠炎患者适用，但湿热泻痢者忌用。
4、抑菌抗炎
体外实验表明吴茱萸水煎剂对金黄色葡萄球菌、痢疾杆菌有抑制作用，其柠檬苦素类化合物能降低TNF-α等炎性因子水平，可用于辅助治疗细菌性肠炎。
5、调节血压
吴茱萸碱具有α受体阻滞作用，能扩张外周血管，临床配伍钩藤、夏枯草可用于肝阳上亢型高血压的辅助治疗，但需监测血压变化避免低血压。
使用吴茱萸需注意：内服用量1.5-4.5克，过量可引起视力模糊、胸闷等中毒反应；阴虚有热者禁用；外用时研末醋调敷脐可治小儿腹泻。建议在中医师指导下辨证使用，避免与降压药、抗凝药同服。日常储存应置于阴凉干燥处，防止霉变。
