中药灌肠的作用主要有清热解毒、活血化瘀、通腑泄浊、软坚散结、扶正固本。该疗法是将煎煮好的中药液通过肛门注入直肠或结肠，利用肠道黏膜吸收药物成分以治疗疾病。
1、清热解毒
此作用主要针对体内热毒炽盛引起的病症。当人体出现高热不退、痢疾脓血或严重的肠道感染时，苦寒性质的中药液直达病所，能迅速清除肠道内的湿热毒邪。这种方法常用于治疗溃疡性结肠炎急性发作期或细菌性痢疾，通过局部高浓度药物接触炎症黏膜，抑制病原微生物生长，减轻肠道充血水肿，从而缓解腹痛和里急后重等症状，避免热毒进一步内陷营血。
2、活血化瘀
该功效适用于气血运行不畅导致的瘀血阻滞证候。对于慢性盆腔炎、子宫内膜异位症或术后肠粘连引起的腹部刺痛、固定不移的包块，使用具有活血通络功效的中药进行灌肠，可促进盆腔及腹腔局部的血液循环。药物经直肠静脉丛吸收后，能改善微循环障碍，加速炎性渗出物的吸收与消散，松解纤维组织粘连，有效缓解因瘀血阻滞引发的疼痛和组织硬化问题。
3、通腑泄浊
此作用侧重于解决腑气不通和浊毒内停的问题。在急性胰腺炎、单纯性肠梗阻或肾功能不全导致毒素蓄积的情况下，通过灌入大黄、芒硝等泻下类药物，能刺激肠蠕动，促进粪便及肠道内有毒代谢产物的排出。这不仅减轻了肠道负担，降低了腹内压，还能通过肠道透析原理减少尿毒症毒素的重吸收，对于恢复胃肠动力和清除体内蓄积的代谢废物具有显著效果。
4、软坚散结
针对病程较长形成的有形实邪，如卵巢囊肿、子宫肌瘤或前列腺增生等良性肿块，中药灌肠发挥软坚散结之功。药物透过直肠壁渗透至邻近器官，直接作用于病灶区域，改变局部组织的病理状态。长期规律治疗有助于软化增生的组织，缩小肿块体积，改善因占位效应引起的压迫症状，尤其适用于不愿手术或身体虚弱无法耐受手术的患者作为辅助治疗手段。
5、扶正固本
对于久病体虚、脾胃功能低下无法口服药物的患者，此法起到扶正固本的作用。选用补气养血或温阳健脾的药物灌肠，避开了肝脏的首过效应和胃酸对药性的破坏，提高了生物利用度。药物通过肠道吸收进入全身循环，能够调节机体免疫功能，改善营养不良状态，增强患者体质，促进受损黏膜修复，特别适合慢性消耗性疾病或肿瘤放化疗后的康复调理。
接受中药灌肠治疗期间，患者需注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性、生冷油腻及难以消化的食物，以防加重肠道负担影响疗效。治疗前应尽量排空大便，以便药物在肠道内保留更长时间被充分吸收。操作时药液温度应控制在接近体温范围，流速不宜过快，若出现剧烈腹痛、心慌冷汗等不适须立即停止并告知医护人员。治疗后建议卧床休息片刻，尽量延长药液在体内的保留时间，同时配合适度的腹部热敷以促进药物扩散和吸收，日常需保持会阴部清洁卫生，预防继发感染。
