药物通常不能彻底治愈尖锐湿疣，但可以作为重要的辅助治疗手段。尖锐湿疣的治疗主要有外用药物、物理治疗、手术治疗、光动力治疗以及免疫调节治疗等方式。
一、外用药物
外用药物是治疗尖锐湿疣的常用方法，主要通过局部涂抹来清除疣体。例如咪喹莫特乳膏是一种免疫调节剂，可以诱导局部产生免疫反应来清除人乳头瘤病毒感染。鬼臼毒素酊则能抑制疣体细胞分裂，使其坏死脱落。三氯醋酸溶液通过化学腐蚀作用破坏疣体组织。这些药物主要适用于数量较少、体积较小的疣体，需要在医生指导下规范使用，并注意保护周围正常皮肤，避免过度使用导致皮肤灼伤或溃疡。
二、物理治疗
物理治疗是直接去除可见疣体的核心方法。液氮冷冻治疗利用极低温使疣体组织坏死、脱落，操作相对简便。二氧化碳激光治疗则通过高能量激光气化疣体，具有精度高、出血少的优点。电灼治疗利用高频电刀烧灼疣体。这些方法能快速清除皮损，但主要针对可见病灶，对于潜伏的病毒清除作用有限，治疗后存在一定的复发概率，通常需要与药物或其他疗法联合应用以提高疗效。
三、手术治疗
手术治疗适用于疣体较大、数量较多或特殊部位的尖锐湿疣。例如剪切术直接用手术剪或手术刀切除疣体，适用于带蒂的、较大的疣体。刮除术则用刮匙刮除疣体组织。手术治疗的优点在于能一次性去除大量或巨大的疣体组织，但对于亚临床感染和潜伏感染同样无法根除，术后创面需要妥善护理以防感染，并且也存在复发的可能，常作为综合治疗方案的一部分。
四、光动力治疗
光动力治疗是一种相对较新的疗法，通过外用光敏剂，如氨基酮戊酸，待其被病变细胞吸收后，再用特定波长的红光照射，产生光化学反应选择性破坏疣体及感染细胞。这种方法对肉眼可见的疣体和亚临床感染都有一定治疗作用，具有创伤小、复发率相对较低、可重复治疗的优势，尤其适用于尿道口、宫颈口等腔道内或面积较大的疣体，但治疗费用较高，疗程较长。
五、免疫调节治疗
免疫调节治疗旨在通过增强全身或局部免疫力来对抗人乳头瘤病毒，降低复发率。除了局部使用的咪喹莫特，系统用药如干扰素注射也可作为辅助治疗。这种方法并非直接去除疣体，而是通过调节机体免疫状态，抑制病毒复制，清除潜伏感染。它常与物理或手术治疗联合使用，用于预防复发或治疗反复发作、顽固性的病例，但起效较慢，且效果存在个体差异。
尖锐湿疣由人乳头瘤病毒感染引起，目前尚无任何单一疗法能保证彻底根除病毒永不复发。治疗的关键在于清除可见疣体并尽可能减少复发。患者应前往正规医院皮肤性病科就诊，由医生根据疣体的大小、数量、部位及个人情况制定个体化综合治疗方案。治疗期间及治疗后，应注意保持患处清洁干燥，避免搔抓，穿着宽松透气的棉质内衣。饮食上宜清淡，避免辛辣刺激性食物，戒烟限酒，保证充足睡眠，适当锻炼以增强机体抵抗力。同时，应使用安全套以降低传染风险，并建议性伴侣同时进行检查。定期复查至关重要，以便及时发现并处理复发病灶。
