过氧苯甲酰凝胶主要用于治疗痤疮，具有杀菌、溶解粉刺和抑制皮脂分泌的作用。
过氧苯甲酰凝胶能有效杀灭痤疮丙酸杆菌，这种细菌是导致痤疮炎症反应的主要病原体。药物通过释放活性氧破坏细菌细胞结构，减少皮肤表面的细菌数量，从而缓解红肿、脓疱等炎症性痤疮症状。适用于轻中度炎症性痤疮的治疗。
该药物可通过氧化作用软化角质层，促进毛囊口堵塞的角质栓溶解，疏通堵塞的毛囊皮脂腺导管。对白头粉刺和黑头粉刺均有改善效果，能预防微粉刺进一步发展为炎性痤疮。使用时可能出现轻微的脱屑现象属于正常药物反应。
过氧苯甲酰凝胶具有轻度抑制皮脂腺分泌的作用，能减少皮肤表面油脂堆积。主要通过调节毛囊角化过程，间接影响皮脂排出量，但不会导致皮肤过度干燥。这种特性使其特别适合油性皮肤和混合性皮肤痤疮患者使用。
药物可通过降低中性粒细胞趋化性和抑制炎症介质释放，减轻痤疮引起的红斑、肿胀等局部炎症反应。对丘疹、脓疱等浅表炎症性皮损效果显著，但对于结节、囊肿等深部痤疮病变效果有限。
长期规律使用可维持治疗效果，减少痤疮复发概率。药物能够持续控制痤疮丙酸杆菌繁殖，保持毛囊通畅，调节皮脂分泌平衡。建议炎症消退后继续维持治疗一段时间，但须注意可能出现皮肤干燥、刺激等不良反应。
使用过氧苯甲酰凝胶时建议从低浓度开始，逐渐增加使用频率。治疗期间配合温和清洁、保湿防晒等基础护肤，避免与其他刺激性外用药物同时使用。如出现严重皮肤刺激或过敏反应应及时停用并咨询医生。同时保持规律作息、均衡饮食，限制高糖高脂食物摄入有助于痤疮的整体改善。
