生化妊娠通常由胚胎染色体异常、母体激素水平不足、子宫环境异常、免疫因素或感染等因素引起。早期妊娠丢失中约50%-70%与胚胎自身缺陷相关，属于自然选择机制。
胚胎染色体异常是主要原因，常表现为受精卵分裂过程中出现的非整倍体变异。高龄孕妇卵子质量下降会显著增加风险，35岁以上女性发生率可达20%-25%。母体孕酮分泌不足会导致子宫内膜容受性降低，黄体功能不全者发生风险增加3倍。
子宫解剖结构异常如子宫纵隔、宫腔粘连等改变着床微环境。抗磷脂抗体综合征等自身免疫疾病可能引发胎盘血管血栓形成。弓形虫、风疹病毒等感染也可干扰胚胎发育。
多数情况下无需特殊治疗，建议间隔3个月经周期后再备孕。反复发生需检查染色体、性激素六项、凝血功能及宫腔镜。黄体功能不足者可遵医嘱补充黄体酮，抗磷脂抗体阳性需使用低分子肝素。宫腔粘连患者可能需行宫腔镜分离术。
连续两次生化妊娠建议进行夫妻双方染色体检测。甲状腺功能异常、糖尿病等基础疾病需优先控制。避免接触放射线及化学毒物，备孕期间每日补充0.4-0.8mg叶酸可降低部分风险。
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