肾脓肿引流后多数情况下可以保住肾脏。及时有效的引流配合抗生素治疗能控制感染，保护肾功能。
肾脓肿是否需切除肾脏取决于感染范围及治疗时机。早期发现且脓肿直径小于5厘米时，经皮穿刺引流联合敏感抗生素治疗，肾脏组织损伤较轻，治愈率超过80%。若脓肿已突破肾包膜或形成肾周脓肿，需手术切开引流，但通过充分引流和抗感染，仍可能保留部分肾功能。糖尿病或免疫功能低下患者需更严格监测，此类人群保肾成功率略低。
局限性肾脓肿阶段表现为腰痛、发热，CT显示单个脓腔，此时引流后肾功能恢复良好。多发性脓肿或气肿性肾脓肿阶段可能出现寒战、血压下降，需联合血液透析过渡，保肾概率降低至50%。若进展为脓毒血症或肾皮质广泛坏死，则需紧急肾切除术。治疗期间需动态监测血肌酐、尿量及影像学变化，调整治疗方案。
术后需低盐优质蛋白饮食，每日饮水量维持在2000毫升以上促进代谢。避免剧烈运动防止肾脏撕裂，三个月内定期复查尿常规与肾脏超声。合并高血压或糖尿病患者需严格控制血糖血压，减少对残余肾单位的损害。适度进行八段锦等舒缓运动改善血液循环，但禁止憋尿或长时间保持坐姿。
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