使用藁本时需注意过敏反应、孕妇慎用、避免长期大量服用、配伍禁忌及特殊人群用药安全。藁本作为中药材，具有祛风散寒、除湿止痛等功效，但需在医生指导下规范使用。
部分人群可能对藁本中的挥发油成分过敏，使用后出现皮肤瘙痒、红肿或呼吸困难等症状。首次使用建议小剂量测试，出现过敏应立即停用并就医。过敏体质者需提前告知医生，避免与其他可能引起交叉过敏的中药如白芷、川芎等联用。
藁本活血通络作用较强，可能刺激子宫收缩。妊娠期女性尤其孕早期应禁用，以防引发流产风险。哺乳期女性也需谨慎，避免药物成分通过乳汁影响婴儿。若必须使用，需由中医师评估后调整配伍和剂量。
藁本常规煎服剂量为3-9克，超量服用可能导致恶心、头晕等中毒反应。长期连续使用可能损伤肝肾，建议用药2周后间隔1周再继续。含藁本的中成药如九味羌活丸、川芎茶调散等也需严格遵循说明书剂量。
藁本与抗凝血药如华法林合用可能增加出血风险，与镇静类药物同服会增强中枢抑制作用。中医配伍中需避免与黎芦等相反药物同用，阴虚血热证患者也不宜使用，可能加重口干舌燥等症状。
儿童肝肾功能未健全，须在儿科中医指导下减量使用。老年人代谢能力下降，需警惕蓄积中毒。肝肾功能不全者应禁用或调整剂量，使用期间定期监测肝肾功能指标。手术前两周应停用以防术中出血。
使用藁本期间应忌食生冷油腻食物，避免影响药效吸收。出现心悸、皮疹等不适需立即停药并就医。建议在正规医疗机构购买经过炮制的合格药材，自行采摘野生藁本可能因品种混淆或污染引发风险。储存时需置于阴凉干燥处，防止霉变降低药效。
