接种HPV疫苗后一般可以遵医嘱使用药物，但需避免影响疫苗效果的免疫抑制剂或抗病毒药物。HPV疫苗接种后可能出现局部红肿、发热等轻微反应，通常无须特殊用药；若症状持续或加重，可考虑使用对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等缓解不适，但禁用激素类药物。接种后用药需严格遵循医生指导，避免自行服药干扰免疫应答。
接种HPV疫苗后的常见反应多为局部疼痛、低热或乏力，这些属于正常免疫反应，通常1-2天自行缓解。此时保持接种部位清洁干燥，适当休息即可。若体温超过38.5摄氏度或疼痛明显，可短期使用对乙酰氨基酚片等解热镇痛药，但需注意此类药物可能掩盖其他潜在症状。部分人群接种后可能出现头晕、恶心等不适，一般与疫苗刺激自主神经有关，无须针对性用药，建议平卧休息并补充水分。
少数情况下可能出现过敏反应如荨麻疹或呼吸困难，需立即就医并使用盐酸肾上腺素注射液、地塞米松磷酸钠注射液等急救药物。接种后应避免长期使用免疫抑制剂如环孢素软胶囊、他克莫司胶囊等，可能降低疫苗保护效果。若因其他疾病需用药，应告知医生近期接种史，调整用药方案。接种后1周内不建议使用抗病毒药物如阿昔洛韦片，可能干扰疫苗诱导的抗体产生。
接种HPV疫苗后应保持健康生活方式，避免饮酒和辛辣食物刺激免疫系统。接种部位出现硬结可热敷促进吸收，但无须涂抹药膏。若需同时治疗其他疾病，优先选择不影响疫苗效果的药物类别，如抗生素中的阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等。接种后3天内避免剧烈运动，监测体温变化，出现持续高热或严重过敏反应需及时就医。
