肛门闭锁术后恢复时间通常需要4-6周，具体取决于手术方式、患儿年龄及术后护理情况。术后早期需密切观察伤口愈合及排便功能恢复情况。
术后1-2周为急性恢复期，重点监测伤口感染、肠梗阻等并发症。此时需保持肛门周围清洁干燥，使用医用敷料保护创面。术后2-4周进入功能恢复期，逐步建立规律排便习惯，可通过扩肛训练帮助肛门括约肌功能重建。早产儿或合并其他畸形的患儿恢复期可能延长至8周。
高位肛门闭锁行腹会阴联合手术者，恢复时间比低位闭锁经会阴手术延长2-3周。新生儿期手术较幼儿期手术恢复更快，因组织修复能力强。术后出现吻合口狭窄或直肠黏膜脱垂等并发症时，需二次干预治疗，将显著延长康复周期。
术后6个月内应定期复查肛门直肠测压及超声检查，评估排便控制能力。日常护理需保持高纤维饮食，每日进行肛门收缩锻炼，避免久坐压迫。出现排便困难或肛门渗液时需及时就医，术后1年功能稳定后可视为完全康复。
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