药物性肾损伤多数情况下能恢复正常，但取决于损伤的严重程度、发现和干预的及时性。如果损伤较轻且及时停药并处理，肾功能通常可以完全恢复；如果损伤严重或延误治疗，则可能遗留永久性肾损伤。
对于大多数药物性肾损伤患者，特别是急性肾小管坏死或急性间质性肾炎等常见类型，在及时停用致病药物后，肾功能有很高的概率恢复正常。这类损伤通常是由于药物对肾小管上皮细胞的直接毒性或过敏反应所致，肾脏具有很强的代偿和修复能力。在损伤初期，患者可能仅表现为尿量减少、血肌酐轻度升高，此时若能迅速识别并停用相关药物，同时进行充分的水化治疗以促进药物排泄，并针对病因使用如糖皮质激素等药物控制免疫反应，多数患者的肾功能可在数周至数月内逐步恢复至基线水平。部分患者可能需要短期接受对症支持治疗，如使用利尿剂呋塞米片来减轻水肿，或使用碳酸氢钠片来纠正代谢性酸中毒，这些措施有助于为肾脏修复创造良好的内环境。
少数情况下，药物性肾损伤可能无法完全恢复正常。这通常发生在损伤极为严重或持续存在的情况下，例如患者服用了大剂量的肾毒性药物，或者本身存在高龄、糖尿病、慢性肾病等基础疾病，导致肾脏储备功能不足。当肾小管上皮细胞发生广泛坏死，或肾间质出现严重纤维化时，肾脏的修复能力会显著下降，可能逐渐发展为慢性肾脏病甚至终末期肾病。这类患者可能表现为持续性的血肌酐升高、蛋白尿或高血压，需要使用血管紧张素转换酶抑制剂如卡托普利片来控制血压和减少蛋白尿，并长期监测肾功能。对于进展至终末期的患者，则可能需要依赖肾脏替代治疗如血液透析或腹膜透析来维持生命。
为了最大程度地促进药物性肾损伤的恢复，建议患者严格遵医嘱用药，避免自行服用成分不明的药物或保健品，尤其是止痛药、抗生素和中草药。在用药期间注意观察尿量、尿色变化，并定期复查尿常规和肾功能。一旦确诊药物性肾损伤，应立即停用可疑药物，并在医生指导下进行充分的水化治疗和必要的药物干预，同时保持低盐优质低蛋白饮食，避免劳累和感染，为肾脏修复提供最佳条件。
