臭牡丹具有清热解毒、祛风除湿、活血消肿等作用，主要用于治疗湿疹、风湿痹痛、跌打损伤等疾病。其主要作用包括改善皮肤炎症、缓解关节疼痛、促进局部血液循环等。
臭牡丹的根、叶含有黄酮类、挥发油等成分，能抑制金黄色葡萄球菌等病原微生物生长，适用于湿热型湿疹、痈肿疮毒。患者可遵医嘱使用臭牡丹煎汤外洗或配伍苦参、白鲜皮等制成复方制剂，如湿疹膏、消炎止痒洗剂。皮肤溃烂者需避免直接涂抹鲜品汁液。
其醇提取物可降低关节滑膜炎症因子表达，对风湿性关节炎引起的关节肿胀、晨僵有效。常与威灵仙、独活等配伍制成风湿贴膏或关节止痛胶囊。使用期间需观察是否出现皮肤过敏，孕妇禁用含酒精提取的外用制剂。
臭牡丹能扩张毛细血管，加速皮下淤血吸收，配合红花、三七可治疗跌打损伤所致的局部青紫疼痛。可制成消肿止痛酊或复方跌打药酒外擦，皮肤破损处禁用。骨折患者需先进行影像学检查排除骨结构异常。
实验显示其多糖成分能增强巨噬细胞吞噬功能，辅助改善反复呼吸道感染。常与黄芪、白术等组成玉屏风颗粒或补中益气丸，体虚易感冒者可在医生指导下服用。自身免疫性疾病患者慎用免疫调节类制剂。
局部应用其水煎剂可通过阻断组胺受体减轻蚊虫叮咬、荨麻疹的瘙痒感。可制成止痒喷雾或配合薄荷脑制成清凉油。眼部及黏膜周围禁用，儿童使用需稀释浓度。
使用臭牡丹时需辨证施治，外用药避免接触眼睛及破损皮肤。内服制剂可能出现恶心、腹泻等胃肠反应，应饭后服用。孕妇、哺乳期妇女及肝肾功能不全者慎用。建议在中医师指导下配伍使用，治疗期间忌食辛辣刺激食物，保持患处清洁干燥。风湿病患者可配合艾灸足三里等穴位增强疗效。
