明目蒺藜丸具有清热散风、明目退翳的功效，主要用于治疗上焦火盛引起的暴发火眼、云蒙障翳、羞明多眵、眼边赤烂、红肿痛痒、迎风流泪等眼部症状。
明目蒺藜丸中的蒺藜、菊花等成分能疏风清热，针对外感风热或肝火上炎导致的眼睑红肿、畏光等症状。若因用眼过度合并干涩，可搭配人工泪液缓解；若伴随头痛，需排查青光眼等器质性疾病。
方中蝉蜕、决明子等药物能消散角膜薄翳，改善视物模糊。对于早期老年性白内障或角膜炎恢复期出现的翳障有一定辅助作用，但需注意与卡他性结膜炎、病毒性角膜炎等疾病鉴别。
黄连成分可缓解眼睑湿疹、过敏性结膜炎引发的瘙痒和睑缘充血。合并细菌感染时可能出现黄色分泌物，此时需联合左氧氟沙星滴眼液等抗生素治疗。
对泪液分泌异常的迎风流泪症状有调节作用。若长期流泪伴眼干，需排查干眼症或泪道阻塞，必要时进行泪小点栓塞术等治疗。
通过抑制前列腺素合成减轻结膜充血疼痛，适用于急性结膜炎初期。但伴随视力骤降或剧烈眼痛时，须立即排查急性闭角型青光眼等急症。
服用明目蒺藜丸期间应避免辛辣油腻饮食，注意用眼卫生，佩戴防尘眼镜减少刺激。糖尿病患者及儿童应在医师指导下使用，服药3天后症状无改善或出现视力变化、眼压升高时需及时停用并就诊。眼局部可配合冷敷缓解充血，但勿直接冰敷眼球。季节性过敏人群建议提前2周遵医嘱预防性用药。
