藿香正气丸主要用于治疗胃肠型感冒、急性胃肠炎、消化不良等疾病，适用于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿引起的头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻等症状。
1、胃肠型感冒
胃肠型感冒多由病毒感染引起，常见腹痛腹泻、恶心呕吐伴低热症状。藿香正气丸能解表化湿，缓解外感风寒内挟湿滞导致的胃肠不适。患者可表现为舌苔白腻、肠鸣漉漉，严重时可能出现脱水。合并细菌感染时需联用诺氟沙星胶囊或蒙脱石散。
2、急性胃肠炎
因饮食不洁或生冷刺激引发的非特异性炎症，常见水样便、脐周绞痛。藿香正气丸通过苍术、厚朴等成分燥湿和中。治疗期间应配合口服补液盐防止电解质紊乱，若出现黏液脓血便需加用盐酸小檗碱片。
3、消化不良
适用于湿阻中焦导致的食积腹胀，可见嗳气酸腐、大便溏黏。该药能促进胃肠蠕动，但器质性疾病如胃溃疡引起的消化不良需配合奥美拉唑肠溶胶囊治疗。长期症状不缓解应排查幽门螺杆菌感染。
4、暑湿感冒
夏季湿邪侵袭所致，特征为身热不扬、头重如裹、口渴不欲饮。藿香正气丸可配伍金银花露增强解暑效果，高热时需联合布洛芬混悬液。使用期间忌服滋补性中药。
5、水土不服
旅行或迁居后出现的胃肠功能紊乱，与水质、饮食变化相关。该药能调节胃肠菌群平衡，通常用药2-3天见效。伴有严重失眠者可短期联用地西泮片。
服用藿香正气丸期间需忌食生冷油腻，糖尿病患者应选择无糖剂型。胃炎患者建议饭后服用以减轻刺激，服药2天后症状无改善或出现皮疹等过敏反应应立即停药就医。治疗期间可配合饮用陈皮生姜水辅助祛湿，避免长时间处于空调环境。
