亚麻籽及其制品的主要禁忌包括过敏体质者慎用、胃肠功能紊乱者避免空腹食用、甲状腺疾病患者需控制摄入量、凝血功能障碍者慎用、孕妇及哺乳期女性应咨询医生。亚麻籽富含α-亚麻酸和膳食纤维，但特殊人群需注意潜在风险。
1、过敏体质
亚麻籽可能引发过敏反应，表现为皮肤瘙痒、荨麻疹或呼吸困难等症状。对芝麻、坚果等食物过敏者更易出现交叉过敏。若食用后出现口唇麻木或胃肠道不适，应立即停用并就医。过敏体质者初次尝试建议从微量开始，观察24小时无反应再逐步增量。
2、胃肠不适
亚麻籽中不可溶性膳食纤维含量较高，胃肠炎、肠易激综合征患者空腹食用可能加重腹胀腹泻。建议将每日摄入量控制在10克以内，优先选择熟制或研磨后的形态，搭配足量水分可降低刺激。术后恢复期或存在肠梗阻风险者应完全避免。
3、甲状腺影响
亚麻籽含有的生氰糖苷可能干扰甲状腺对碘的利用，甲状腺功能减退患者长期大量食用需监测激素水平。每日摄入超过30克可能抑制甲状腺过氧化物酶活性，建议烹饪加热破坏抗营养物质，并与含碘食物间隔2小时食用。
4、凝血功能
亚麻籽中的ω-3脂肪酸具有抗血小板聚集作用，服用华法林等抗凝药物者联合使用可能增加出血风险。术前两周应停止高剂量补充，日常摄入需保持稳定剂量。出现异常淤青或牙龈出血时应及时检测凝血功能。
5、特殊生理期
亚麻籽植物雌激素可能影响激素敏感型乳腺癌患者病情，孕妇过量摄入存在理论上的早产风险。哺乳期母亲食用后需观察婴儿是否出现消化不良。建议这两类人群每日摄入不超过5克，且须经产科或肿瘤科医生评估后使用。
日常食用亚麻籽建议选择低温烘焙的熟籽，避免生籽中氰化物残留风险。存储时需密封避光防止氧化酸败，开封后冷藏并在1个月内用完。可将研磨后的亚麻籽粉加入燕麦粥或酸奶，既能提升营养价值又可降低胃肠刺激。出现持续腹痛、皮疹或月经异常等不适时，应立即停用并寻求专业医疗指导。
