第一次吃紧急避孕药，如果只是偶尔使用，通常危害不大，主要可能导致月经周期暂时性紊乱、恶心呕吐等反应；但如果频繁使用，则可能导致更明显的月经失调甚至影响短期生育功能。紧急避孕药是一种高剂量的激素类药物，其作用机制是抑制或延迟排卵、干扰受精过程，并改变子宫内膜环境以防止受精卵着床。
对于大多数女性来说，偶尔服用一次紧急避孕药，身体通常能较快代谢掉其中的激素成分，出现的反应大多是轻微且短暂的。常见的包括服药后几天内的恶心、呕吐、头痛、乳房胀痛或点滴出血，这些症状一般持续不超过24小时，通常无须特殊处理。月经周期方面，可能出现提前或推迟几天的情况，但多数在1-2个周期内会恢复正常，不影响后续的正常排卵和受孕能力。所以对没有服药禁忌症的健康人群而言，第一次且仅此一次的使用，不必过度焦虑。
但如果将紧急避孕药当作常规避孕手段，同一周期内多次服用或每个月频繁使用，则危害会明显增加。反复摄入高剂量激素会严重扰乱下丘脑-垂体-卵巢轴的调控功能，导致月经周期长期不规律，出现经量过多、过少或闭经等情况。子宫内膜可能因激素反复刺激而异常增生，影响子宫正常功能，并且在极少数情况下可能增加排卵障碍性不孕的概率。此外，频繁使用还会使药物耐受性增高，导致避孕失败概率逐渐上升。需要特别注意的是，如果服药后出现剧烈下腹痛、重度头晕或持续大量出血，应及时就医排查异位妊娠等急症。
紧急避孕药不适宜反复使用，一年内建议不超过2-3次，更不应作为常规避孕方法。如果不慎发生无保护性行为，事后72小时内越早服用效果越好，同时应考虑到药物可能引起暂时的胃肠不适，服药后2小时内若发生呕吐可能需要补充服用一次。日常避孕建议优先考虑短效口服避孕药、避孕套或宫内节育器等稳定可靠的方式，可以咨询妇科医生选择最适合自身的方案，并做好每次避孕措施的预先规划，从根源上减少对紧急避孕药的依赖。
