中毒性巨结肠可引发严重并发症，主要影响包括肠穿孔、败血症和多器官功能衰竭。该疾病是溃疡性结肠炎或感染性结肠炎的危急重症，需立即医疗干预。
肠壁全层炎症导致结肠扩张失去收缩功能，可能造成肠黏膜屏障破坏。细菌毒素进入血液后易诱发全身炎症反应，常见表现为持续高热、心率加快和精神状态改变。
结肠肌层断裂可能引发游离性穿孔，腹腔污染引发感染性休克。腹部X线平片显示结肠直径超过6厘米时提示病情危重，CT检查可发现肠壁积气征象。
脓毒血症可能造成急性肾损伤和呼吸窘迫综合征。实验室检查常见白细胞计数异常升高、降钙素原水平显著增高，血气分析显示代谢性酸中毒。
少数患者可能出现中毒性脑病，表现为意识模糊或抽搐。凝血功能异常时可见皮肤瘀斑或消化道出血，需警惕弥散性血管内凝血的发生。
出现持续腹胀伴压痛反跳痛需急诊就诊。治疗需在重症监护病房进行，包括静脉抗生素、糖皮质激素和液体复苏，必要时行结肠切除术。
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