厚朴具有燥湿消痰、下气除满等功效，主要用于湿滞伤中、脘痞吐泻、食积气滞、腹胀便秘、痰饮喘咳等症状。
厚朴的苦温特性有助于化解体内湿浊，对痰饮阻肺引起的咳嗽气喘有明显效果。其活性成分厚朴酚能抑制气道炎症反应，改善慢性支气管炎或哮喘患者的痰多症状。使用时可配伍半夏、茯苓等药物增强祛痰效果，常见剂型包括厚朴颗粒、厚朴止咳口服液。
针对湿阻中焦导致的脘腹胀满，厚朴通过促进胃肠蠕动加速湿邪排出。对于夏季暑湿或饮食不节引起的恶心呕吐、腹泻，可与苍术、陈皮配伍制成厚朴温中汤。现代研究表明其挥发油成分能调节肠道菌群平衡，改善功能性消化不良。
厚朴对食积不化引起的嗳腐吞酸、便秘腹胀有缓解作用。其含有的厚朴碱能增强消化酶活性，临床常与山楂、神曲等配伍使用，如保和丸含厚朴成分。注意实热积滞者需配伍大黄等清热药物共同使用。
厚朴提取物对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用，其抗炎机制与抑制NF-κB信号通路相关。在肠炎、胃炎等炎症性疾病辅助治疗中，可选用厚朴肠溶胶囊减少胃肠道刺激。
厚朴中的木兰箭毒碱能双向调节胃肠平滑肌收缩，既缓解痉挛性腹痛，又改善胃肠动力不足。对于肠易激综合征患者，厚朴配伍白芍可制成痛泻要方颗粒，但孕妇及阴虚内热者慎用。
使用厚朴时需注意辨证施治，湿热内蕴或阴虚火旺者不宜单独使用。建议在中医师指导下选择合适剂型，常规用量为3-10克，入汤剂宜后下以保留挥发油成分。服药期间避免生冷油腻饮食，慢性病患者需定期复查肝肾功能。出现皮疹、心悸等不良反应时应立即停药就医。
