清咽六味散具有清热解毒、利咽消肿的功效，主要用于缓解咽喉肿痛、声音嘶哑等症状。其作用机制与抑制炎症反应、促进黏膜修复有关。
清咽六味散中的连翘、金银花等成分能抑制病原微生物繁殖，减轻咽喉部感染引发的红肿热痛。适用于风热犯肺引起的急性咽炎，常伴随发热、咳嗽痰黄等症状。使用期间需避免辛辣刺激食物以防加重黏膜损伤。
方中桔梗、薄荷具有宣肺利咽作用，可改善声带充血水肿导致的声音嘶哑。对用嗓过度或烟酒刺激引发的慢性咽炎有缓解效果，症见咽喉异物感、干痒不适。建议配合蒸气吸入增强局部药效。
黄芩苷等活性成分能降低前列腺素合成，有效缓解吞咽疼痛。对于反复发作的扁桃体周围炎，可减轻颌下淋巴结肿痛。需注意本品不替代抗生素治疗细菌感染。
部分研究显示其多糖成分可增强吞噬细胞活性，辅助改善免疫功能低下者的咽喉反复感染。更年期女性因雌激素水平变化易发的干燥性咽炎可酌情使用。
通过促进上皮细胞增殖，加速放疗后或胃酸反流导致的咽喉黏膜损伤修复。对伴有烧心、反酸的反流性咽喉炎患者，需同步治疗原发病。
使用清咽六味散期间应保持每天2000毫升水分摄入，室内湿度维持在50%左右有助于缓解咽干。避免长时间大声说话或处于粉尘环境，戒烟限酒可降低复发概率。若用药3天症状未缓解或出现皮疹等不良反应，应立即停用并就诊。风寒感冒导致的咽痒咳嗽不宜使用该方剂，孕妇及哺乳期女性用药前需咨询医师。
