耐药菌感染的表现通常按病情进展呈现，早期多为发热、寒战，进展期出现呼吸困难、意识模糊，终末期可发展为感染性休克、多器官功能衰竭。
耐药菌感染初期，患者常表现为持续性发热，体温升高且常规抗生素治疗效果不佳。这种发热可能伴随寒战、乏力等全身症状，是由于细菌在体内繁殖并释放毒素刺激免疫系统所致。此时若未及时识别耐药特性并调整用药方案，感染灶可能迅速扩大。针对此类情况，需在医生指导下进行细菌培养及药敏试验，根据结果选用敏感的抗菌药物如万古霉素注射液、美罗培南注射液或利奈唑胺片等进行针对性治疗，同时密切监测体温变化及炎症指标。
随着感染进展，感染部位会出现明显的红、肿、热、痛等炎症反应，皮肤软组织感染尤为常见。耐药菌导致的局部病变往往愈合缓慢，甚至形成脓肿或坏死性筋膜炎。这与细菌产生的酶类物质破坏组织屏障有关，普通消炎药难以奏效。治疗上除了需要清创引流外，还必须依据药敏结果使用替加环素注射液、头孢他啶阿维巴坦注射液等强效抗生素控制感染扩散，防止病情进一步恶化至深部组织或血液系统。
当耐药菌侵袭呼吸道引发肺炎时，患者会出现呼吸频率加快、气促、咳嗽咳痰等症状，严重时伴有低氧血症。这是由于肺部炎症渗出导致气体交换功能障碍，常见于多重耐药鲍曼不动杆菌或耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌感染。此类病情进展迅速，易导致急性呼吸窘迫综合征。临床处理需立即给予呼吸支持，并联合应用多黏菌素E甲磺酸钠注射液、厄他培南钠注射液等药物进行抗感染治疗，同时加强气道管理以促进痰液排出。
若感染未能有效控制，细菌毒素入血可引起脓毒症，进而影响中枢神经系统，导致患者出现嗜睡、烦躁不安、谵妄甚至昏迷等意识障碍表现。这是病情危重的信号，提示可能存在脑膜炎或严重的全身炎症反应综合征。此时必须争分夺秒地进行抢救，在维持生命体征稳定的基础上，果断使用庆大霉素注射液、阿米卡星注射液等对特定耐药菌有效的药物，并结合影像学检查排除颅内并发症，以期逆转神经功能损害。
感染发展至终末期，持续的炎症风暴可导致心、肺、肾、肝等多个重要器官功能相继衰竭，表现为少尿无尿、血压下降、黄疸加深等危急征象。这是耐药菌感染最严重的后果，死亡率极高，主要源于微循环障碍及细胞代谢紊乱。救治难度极大，需在重症监护室进行全方位支持治疗，包括血液净化、机械通气等，并尝试联合使用新型抗生素如头孢地尔注射液等，力求清除病原菌，恢复器官灌注，但预后往往取决于基础身体状况及干预时机。
日常生活中应注重个人卫生，勤洗手、保持环境清洁通风，避免滥用抗生素以减少耐药菌产生风险。一旦出现不明原因发热或感染症状加重，务必及时前往正规医疗机构就诊，配合医生完成相关检查，严格遵医嘱规范用药，切勿自行购买或随意停用抗菌药物，以免延误最佳治疗时机导致病情恶化，同时加强营养支持，适度运动以增强机体免疫力，共同抵御耐药菌的威胁。
