HPV感染多数情况下无明显症状，部分患者可能出现生殖器疣或宫颈病变。HPV人乳头瘤病毒感染的症状表现主要与病毒亚型及感染部位相关，常见症状包括皮肤黏膜疣体、宫颈细胞学异常等。
低危型HPV感染主要表现为皮肤或黏膜疣体。生殖器疣尖锐湿疣是典型表现，好发于外阴、肛门、阴茎等部位，初期为微小淡红色丘疹，逐渐增大呈菜花状或乳头状突起。扁平疣多出现在面部和手背，表现为肤色或褐色扁平丘疹。跖疣则发生于足底，表面粗糙伴黑色出血点，行走时有压痛感。
高危型HPV感染早期通常无自觉症状，持续感染可能导致宫颈上皮内瘤变CIN。部分患者出现阴道不规则出血，包括同房后出血、绝经后出血或月经间期出血。异常阴道分泌物增多，可呈现血性或脓性。病情进展至宫颈癌时可能出现下腹痛、消瘦等全身症状。
其他特殊部位感染可引发相应症状。口腔HPV感染可能表现为反复口腔溃疡或喉部乳头状瘤。呼吸道乳头状瘤病可引起声音嘶哑、呼吸困难。肛周感染除疣体外还可能伴随肛门瘙痒、排便疼痛。
约90%的HPV感染可在1-2年内被免疫系统清除。持续感染高危型HPV如16/18型超过2年时，建议进行阴道镜活检或宫颈锥切术。出现肉眼可见疣体可采用冷冻、激光等物理治疗，禁用腐蚀性药物自行处理。接种HPV疫苗是有效的预防手段，适龄人群应完成全程接种。
