明目上清丸具有清肝明目、祛风止痛的作用，适用于肝火旺盛、风热上攻引起的目赤肿痛、畏光流泪、头晕目眩等症状。
明目上清丸含有决明子、菊花等成分，能清泻肝火，改善因肝火上炎导致的目赤肿痛、视物模糊。肝火旺盛者常伴随口苦咽干、烦躁易怒，此类人群可遵医嘱使用该药。服药期间应避免辛辣刺激食物，脾胃虚寒者慎用。
药物中的防风、白芷等可疏散风热，缓解风热上攻引起的头痛、眼胀及畏光流泪。适用于用眼过度或外感风热导致的急性结膜炎症状。用药时需注意避风休息，若出现皮疹等过敏反应应立即停药。
高血压患者出现头晕目眩伴眼睛充血时，可在医生指导下配合降压药物使用。该药能辅助平抑肝阳，但不宜长期服用，症状缓解后需调整治疗方案。服用期间需监测血压，避免与镇静类药物同用。
对风热型急性结膜炎、睑缘炎等疾病早期的眼睑红肿、分泌物增多有效。建议在发病48小时内使用，配合冷敷可增强疗效。但化脓性眼病或青光眼患者禁用，儿童孕妇等特殊人群须医师指导用药。
短期用于电子屏幕使用过度导致的眼干涩、酸胀，可联合人工泪液缓解症状。连续服用不宜超过7天，若视力持续下降需排查眼底病变。糖尿病患者使用前应咨询医生，服药期间禁烟酒及熬夜。
使用明目上清丸期间应保持饮食清淡，多吃蓝莓、胡萝卜等富含维生素A的食物，避免强光刺激眼睛。每日可做眼周穴位按摩或远眺训练，用药3天后无改善或症状加重需及时眼科就诊。注意药物需密封避光保存，开封后超过有效期禁止服用。
