新生儿肠炎可能表现为呕吐、腹泻、发热、拒奶、腹胀等症状，需结合粪便性状与全身状态综合判断。
胃内容物或胆汁样液体频繁反流，呕吐物可能带有酸臭味。早产儿更易因贲门发育不全出现喷射性呕吐，需警惕脱水及电解质紊乱。
大便次数较平日增加2-3倍，呈蛋花汤样或水样便，可能含有黏液或血丝。轮状病毒感染时粪便呈典型米泔水样，侵袭性细菌感染可出现脓血便。
体温波动在37.8-39℃之间，细菌性肠炎多见稽留热。部分患儿出现体温不升提示病情危重，需立即监测末梢循环状态。
吮吸力减弱或完全抗拒喂养，伴随哭闹不安。长期摄入不足可能导致低血糖，表现为肌张力低下、反应迟钝等神经系统症状。
肠鸣音先亢进后减弱，腹部皮肤发亮，严重时可见肠型。坏死性小肠结肠炎患儿可能出现板状腹，需急诊腹部平片排除肠穿孔。
母乳喂养期间母亲需避免进食生冷刺激食物，配方奶喂养应严格消毒奶具。每日记录排便次数与性状，体温超过38℃或出现嗜睡、尿量减少等脱水征象时需急诊处理。可进行被动蹬腿运动促进肠蠕动，喂养后保持头高脚低体位30分钟。
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