十三味红花丸适用于气滞血瘀所致的头痛、眩晕、心悸、失眠、肢体麻木等症状，也可用于轻度心绞痛和血管性头痛的辅助治疗。主要适应症包括冠心病轻度心绞痛、高原红细胞增多症早期、血管性头痛等，该药物含有活血化瘀成分，孕妇、经期女性、出血性疾病患者禁用。
十三味红花丸中的红花、人工麝香等成分能改善心肌供血，缓解气滞血瘀引发的胸闷、心前区隐痛。适用于劳累后发作的稳定性心绞痛辅助治疗，但急性心肌梗死或严重心绞痛需联合硝酸甘油片、单硝酸异山梨酯缓释片等急救药物。此类患者服用时应监测心率血压变化。
该药可通过抑制血小板聚集改善高原缺氧引发的头晕、紫绀症状。对血常规检查显示血红蛋白轻度升高（男性180-200g/L、女性160-180g/L）有效，若合并严重肺动脉高压需配合乙酰唑胺片治疗。建议服药期间定期检测血液黏度指标。
针对搏动性偏头痛或紧张性头痛，其川芎、当归等成分可舒张脑血管。适合反复发作性头痛，每次持续2-48小时且无先兆者，与发作时服用布洛芬颗粒、对乙酰氨基酚片等镇痛药间隔2小时使用。伴恶心呕吐的偏头痛需联用甲氧氯普胺片。
对脑供血不足引发的头晕目眩、行走不稳症状，联合银杏叶片使用时能增强微循环。适用颈动脉超声显示斑块狭窄＜50%的患者，严重椎基底动脉供血不足需加用盐酸氟桂利嗪胶囊。
改善糖尿病周围神经病变或血栓闭塞性脉管炎导致的肢体麻木、发凉，配合胰激肽原酶肠溶片可增强疗效。下肢动脉ABI指数＞0.9的轻度缺血适用，静息痛或溃疡需血塞通软胶囊联合治疗。
服用十三味红花丸期间应避免辛辣油腻饮食，合并高血压或糖尿病患者需持续监测原发病指标。中成药起效较慢，一般需连续服用15-30天观察疗效，若症状无缓解或出现牙龈出血、皮下瘀斑等不良反应应立即停药就诊。该药不宜与抗凝药华法林钠片、阿司匹林肠溶片同用，老年人及肝肾功能不全者应减量。
