复方黄连素片具有清热燥湿、行气止痛、止泻止痢的作用，主要用于治疗大肠湿热、赤白下痢、里急后重或暴注下泻、肛门灼热等症状。
1、治疗痢疾
复方黄连素片对细菌性痢疾、阿米巴痢疾等感染性腹泻具有显著疗效。其中盐酸小檗碱可抑制痢疾杆菌、大肠杆菌等病原微生物生长，减轻肠道炎症反应；木香、吴茱萸等成分能缓解里急后重、腹痛等伴随症状。用药期间需注意监测电解质平衡。
2、缓解肠炎
适用于急慢性肠炎引发的腹泻腹痛，其抗炎成分可降低肠黏膜充血水肿。服药后可能出现轻微胃肠道反应，建议餐后服用。若出现皮疹等过敏反应应立即停药。
3、改善消化不良
对饮食不洁导致的胃肠功能紊乱有调节作用，通过抑制胃肠过度蠕动减轻腹泻症状。需与其他助消化药物区分，不适用于胃酸缺乏型消化不良。
4、辅助口腔溃疡
所含黄连素具有一定抗菌作用，局部研磨外敷可辅助治疗轻型口腔溃疡。但需注意本品口服制剂并非专门针对口腔疾病设计，严重溃疡仍需专科用药。
5、调节肠道菌群
通过抑制有害菌过度繁殖间接调节肠道微生态平衡，但长期使用可能影响正常菌群。建议配合益生菌使用，疗程不超过7天，孕妇及过敏体质慎用。
服用复方黄连素片期间应保持清淡饮食，避免辛辣刺激性食物。慢性腹泻患者需排查原发病因，配合补液防止脱水。用药3天症状无改善或出现高热、脓血便时应及时就医。储藏时需避光防潮，注意本品不宜与含鞣质的中药同服，儿童用量需遵医嘱调整。
