鼻通滴鼻剂的禁忌主要是对药物成分过敏者禁用，患有严重心血管疾病、高血压、甲状腺功能亢进、青光眼的患者慎用，孕妇及哺乳期妇女应在医生指导下使用。
鼻通滴鼻剂含有盐酸萘甲唑啉等成分，可能引发过敏反应。过敏体质者使用后可能出现皮肤瘙痒、红肿、呼吸困难等症状。若出现过敏反应应立即停用并用清水冲洗鼻腔，必要时就医。使用前建议进行皮肤测试或咨询医生。
该药物中的血管收缩剂可能加重心脏负担，诱发心律失常或血压升高。冠心病、心绞痛患者使用后可能出现心悸、胸闷等症状。心血管疾病患者需严格遵医嘱，优先选择生理盐水冲洗等替代方案。
鼻通滴鼻剂可通过鼻黏膜吸收入血，导致全身性血管收缩。高血压患者使用后可能出现头晕、头痛等血压骤升症状。建议高血压患者控制单次用量不超过1-2滴，连续使用不超过3天。
药物中的拟交感神经成分可能模拟甲状腺激素作用，加重甲亢症状。患者使用后可能出现手抖、多汗、心动过速等表现。甲亢患者应选择不含血管收缩剂的鼻腔喷雾替代。
滴鼻后药物可能经鼻泪管进入眼部，引起瞳孔散大和眼压升高。青光眼患者使用后可能出现视物模糊、眼痛等症状。建议使用时按压内眦部位5分钟阻断药物流向眼部。
使用鼻通滴鼻剂期间应避免同时服用含麻黄碱的感冒药，防止药物叠加效应。鼻腔干燥者可配合使用生理性海水喷雾保持湿润。若出现鼻腔灼烧感、反复鼻出血等不良反应需及时停药就医。长期使用可能引起药物性鼻炎，建议连续使用不超过7天。儿童使用需严格按体重调整剂量，3岁以下婴幼儿不建议自行使用。
