过氧苯甲酰凝胶使用时的注意事项主要有避免接触眼口黏膜、可能出现皮肤刺激反应、与其他药物相互作用、过敏体质者慎用、孕妇哺乳期禁用。
过氧苯甲酰凝胶具有强氧化性，不慎接触眼睛可能导致结膜充血、角膜损伤。涂抹时应避开嘴唇周围，误食可能引起消化道刺激症状。若不慎入眼需立即用清水冲洗15分钟，口腔接触时用牛奶中和后就医处理。凝胶涂抹后建议洗手避免药物转移。
该药物常见皮肤干燥脱屑、灼热刺痛等反应，多数在用药2-4周后逐渐耐受。若出现明显红斑水肿或剧烈疼痛需停药。建议初次使用时选择低浓度制剂，薄涂于患处测试耐受性。配合使用无油保湿乳可减轻刺激，但需间隔30分钟以上使用。
与维A酸类药物联用可能加剧皮肤刺激，需间隔12小时交替使用。同时使用含硫磺、水杨酸的外用药可能降低药效。口服异维A酸期间禁用本药，可能增加皮肤敏感风险。使用抗生素软膏时需咨询医生确定用药顺序。
对苯甲酸衍生物过敏者可能出现接触性皮炎，表现为用药部位瘙痒肿胀。用药前可在耳后或前臂小面积试用24小时观察反应。过敏反应严重时可口服氯雷他定片缓解，外用丁酸氢化可的松乳膏辅助治疗。既往有药物过敏史者需提前告知医生。
过氧苯甲酰可能通过皮肤吸收影响胎儿发育，哺乳期使用可能导致婴儿接触风险。备孕期间建议改用克林霉素磷酸酯凝胶等B类外用药。特殊情况必须使用时需严格避孕，用药期间暂停母乳喂养。青春期女性使用需注意避开月经周期皮肤敏感阶段。
使用过氧苯甲酰凝胶期间建议选择温和无皂基洁面产品，避免日光暴晒及高温环境。治疗痤疮时需保持患处清洁但不可过度擦洗，配合清淡饮食减少皮脂分泌。若用药部位出现水疱、渗出等严重反应，应及时停用并就诊皮肤科。药物需25℃以下避光保存，开封后6个月内用完。
