加味藿香正气丸具有解表化湿、理气和中的功效，主要用于治疗外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿引起的感冒、胃肠型感冒等疾病。
加味藿香正气丸中的藿香、紫苏等成分能发散风寒，白芷、陈皮可芳香化湿，适用于暑湿季节或受凉后出现的恶寒发热、头痛昏重等症状。对于胃肠型感冒伴随的胸闷腹胀，该药能帮助缓解湿邪困阻中焦的症状。风寒感冒患者服用后可能伴随微微汗出，促进湿邪排出。
方中苍术、厚朴配伍可燥湿健脾，大腹皮、茯苓能利水渗湿，共同调理胃肠气机。针对湿滞引起的脘腹胀痛、呕吐泄泻等症状，通过调节胃肠蠕动功能改善消化异常。慢性浅表性胃炎患者出现类似症状时，可在医生指导下短期配合使用。
对于饮食不节或生冷刺激导致的胃肠功能紊乱，该药能减少肠鸣音亢进、大便溏稀等不适。药效通过抑制肠道平滑肌过度收缩发挥作用，但不宜用于细菌性痢疾等感染性腹泻。服用期间需配合清淡饮食，避免油腻食物加重胃肠负担。
夏季湿热环境引起的头晕胸闷、食欲减退等症状，可通过该药祛湿醒脾的作用改善。方中甘草、生姜能调和药性，减轻暑湿对消化系统的刺激。高温作业人群出现先兆中暑症状时，可作为辅助调理用药，但重度中暑仍需优先补液治疗。
药物中的白芷、陈皮等具有轻度镇痛作用，能缓解湿邪阻滞引起的头痛、肌肉酸痛。但对于炎症性或器质性疾病导致的疼痛，如急性胃肠炎剧烈腹痛时，须及时就医明确诊断，不可单纯依赖本药。
使用加味藿香正气丸期间应注意避风寒，忌食生冷油腻食物。服药3天后症状未改善或出现发热加重、腹泻带血等情况需停药就医。高血压、心脏病等慢性病患者及孕妇应在医师指导下使用，不宜与滋补性中药同服。存储时需密封防潮，性状发生改变时禁止服用。
