清热安宫丸主要用于治疗热病神昏、中风癫痫等热邪内闭证。该中成药含有牛黄、麝香等成分，具有清热解毒、开窍醒神的功效，适用于由高热、脑炎、脑血管意外等疾病引起的意识障碍和惊厥症状。
一、热病神昏
清热安宫丸可缓解因感染性疾病导致的高热神昏，如流行性脑脊髓膜炎、乙型脑炎等中枢神经系统感染。其含有的牛黄能抑制中枢兴奋，黄芩苷有抗炎作用，对于发热伴意识模糊、谵妄等症状具有一定改善效果。需注意该药不能替代抗感染治疗，须配合抗生素如注射用头孢曲松钠等联合使用。
二、中风闭证
适用于缺血性或出血性中风急性期出现的神志不清、牙关紧闭等闭证表现。方中麝香可扩张脑血管，冰片有助于缓解脑水肿，常与溶栓药注射用阿替普酶或降压药马来酸依那普利片协同使用。但脑卒中患者需先经CT确诊分型，出血性中风禁用活血成分。
三、癫痫发作
对热极生风引起的癫痫大发作有辅助疗效，尤其适用于发作后意识未完全恢复阶段。其中朱砂能镇静抗惊厥，可与抗癫痫药丙戊酸钠片联合使用。但长期服用需监测汞含量，儿童及孕妇慎用。
四、中毒性脑病
对一氧化碳中毒、酒精中毒等所致中枢神经损害出现的躁动、昏迷症状，联合高压氧治疗时可作为辅助用药。所含栀子能促进毒物代谢，但需警惕雄黄中的砷含量，肝功能异常者禁用。
五、小儿高热惊厥
用于3岁以上儿童外感热病引起的惊厥，能缩短惊厥持续时间。使用时需家长注意将药丸研磨后用温水送服，体温超过38.5℃时应配合布洛芬混悬液等退热药，反复发作需排除癫痫可能。
服用清热安宫丸期间忌食辛辣油腻食物，避免与含有重金属的中成药同服。孕妇禁用，哺乳期妇女慎用。因含朱砂、雄黄等成分，连续使用不宜超过7天，长期服用可能导致重金属蓄积中毒。急症症状缓解后应及时就医明确病因，该药作为急救用药不可替代规范治疗。日常应注意保持情绪稳定，高血压患者需规律监测血压，中风高危人群应定期进行脑血管检查。
