菟丝子具有补肾益精、养肝明目、固精缩尿、安胎止泻等作用，主要用于肾虚腰痛、阳痿遗精、尿频遗尿、肝肾不足、目昏耳鸣、脾肾虚泻、胎动不安等症状。
菟丝子味甘性平，归肝、肾、脾经，其补肾益精作用主要体现在改善肾虚引起的腰膝酸软、阳痿早泄等症状。临床常用于治疗男性性功能障碍，常与枸杞子、覆盆子等配伍使用。现代研究表明其提取物可调节下丘脑-垂体-性腺轴功能，改善生殖系统微循环。
菟丝子所含黄酮类成分具有抗氧化作用，能减轻视网膜细胞氧化损伤。对于肝肾不足导致的视物昏花、眼干涩痛，常与熟地黄、菊花等配伍制成复方制剂。动物实验显示其水煎剂可延缓白内障进展，但具体机制仍需进一步研究。
通过增强膀胱括约肌张力发挥缩尿作用，对小儿遗尿、老年人夜尿频多有效。治疗遗精滑泄时多与芡实、金樱子同用，其多糖成分可调节膀胱逼尿肌与括约肌协调性。需注意湿热下注型尿频不宜单独使用。
所含槲皮素等成分能抑制子宫平滑肌过度收缩，配伍续断、桑寄生可用于肾虚型胎动不安。其鞣质成分可收敛肠黏膜，改善脾肾阳虚型慢性腹泻，常与补骨脂、肉豆蔻组成四神丸类方剂。
菟丝子多糖能激活巨噬细胞和T淋巴细胞功能，提高机体非特异性免疫力。实验显示其提取物可提升环磷酰胺致免疫低下小鼠的胸腺指数，临床多用于肿瘤放化疗后免疫辅助治疗，但需在中医师指导下辨证使用。
使用菟丝子时建议煎汤用量6-12克，或入丸散。阴虚火旺者慎用，避免与降压药同服。日常可配伍粳米煮粥调理脾肾，或与黑芝麻打粉冲服。出现过敏皮疹或胃肠不适应立即停用，储存时需防潮防蛀。建议在中医辨证指导下合理应用，避免自行长期大量服用。
