芎菊上清丸具有疏风清热、止痛解表的功效，主要用于外感风邪引起的头痛、偏头痛、鼻塞流涕、恶寒发热等症状。芎菊上清丸的主要成分包含川芎、菊花、防风等中药，其作用机制主要有镇痛抗炎、调节免疫、改善微循环等。
芎菊上清丸中的菊花、薄荷等成分具有疏风清热的功效。风热感冒或风邪入侵时，可能出现头痛、咽喉肿痛、发热等症状，服用该药有助于缓解此类风热表征。菊花中的黄酮类化合物可抑制炎症因子释放，薄荷脑能刺激皮肤冷觉感受器，产生清凉感，帮助退热。
川芎作为方中君药，其川芎嗪成分能扩张脑血管，改善脑部微循环，从而缓解血管神经性头痛或偏头痛。对于外感风寒初起伴随的太阳穴胀痛、枕部疼痛等症状，该药可通过发汗解表、通络止痛发挥作用。
黄芩、栀子等成分具有清热解毒的功效，能减轻上呼吸道感染引发的黏膜充血水肿。对于急性鼻窦炎导致的鼻塞流脓涕、额部压痛等症状，该药可降低毛细血管通透性，抑制组胺释放，缓解鼻窦区炎症反应。
防风、甘草等药物可调节机体免疫功能。风寒感冒初期服用可增强巨噬细胞吞噬能力，促进淋巴细胞转化，缩短病程。对于反复发作的过敏性鼻炎，长期规律用药可降低免疫球蛋白E水平，减少鼻黏膜高反应性。
方中川芎、当归等活血药物能改善头面部微循环障碍。对于紧张性头痛或椎基底动脉供血不足引起的眩晕，该药可增加脑血流量，降低血液黏稠度，缓解因脑血管痉挛导致的头部胀痛、视物模糊等症状。
服用芎菊上清丸期间应禁食辛辣刺激食物，避免加重热性症状。风寒感冒者不宜单独使用该药，需配伍辛温解表药物。服药3天后症状未缓解或出现恶心呕吐等不良反应时应停药就医。高血压、心脏病患者及孕妇慎用，儿童需在医师指导下减量服用。日常注意保暖避风，适度进行八段锦等舒缓运动以增强卫表功能。
